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https://hdl.handle.net/20.500.12104/85158Registro completo de metadatos
| Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Delgado, Eire Reynaga | |
| dc.contributor.author | Ayala Gutiérrez, César Gustavo | |
| dc.date.accessioned | 2021-10-05T20:40:22Z | - |
| dc.date.available | 2021-10-05T20:40:22Z | - |
| dc.date.issued | 2019-10-02 | |
| dc.identifier.uri | https://wdg.biblio.udg.mx | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12104/85158 | - |
| dc.description.abstract | Un total de 7 cepas con la capacidad de degradar hidrocarburos fue aislado de un locación contaminada con hidrocarburos en Zapopan, Jalisco. Se comprobó mediante PCR la presencia del gen de Catecol 1,2-dioxigenasa en A1, B2, G1, G5 y P4; Catecol 2,3-dioxigenasa en B2; y Alcano 1-monooxigenasa en A1. El presente trabajo se centra en A1 y B2. La secuenciación de los genes 16S mostró una homología con Pseudomonas plecoglossicida del 96.66% para A1 y 93.73% para B2. Mientras que la secuenciación de los genes clonados resultó homóloga a Pseudomonas sp. y Pseudomonas putida, además de conservar los dominios característicos de estas enzimas. | |
| dc.description.tableofcontents | RESUMEN .................................................................................................................... vi DEDICATORIA ............................................................................................................. vii AGRADECIMIENTOS .................................................................................................. vii ABREVIATURAS .......................................................................................................... ix ÍNDICE .......................................................................................................................... xi LISTA DE FIGURAS ................................................................................................... xiv LISTA DE TABLAS...................................................................................................... xvi 1. INTRODUCCIÓN ...................................................................................................... 1 2. ANTECEDENTES ..................................................................................................... 2 2.1 Procesos generales de biorremediación ......................................................... 3 2.2 Bacterias degradadoras de hidrocarburos ....................................................... 6 2.3 Enzimas involucradas en el metabolismo de hidrocarburos ............................ 7 2.4 Degradación de catecol mediado por dioxigenasas ........................................ 8 2.5 Catecol dioxigenasas .................................................................................... 12 2.6 Degradación de alcanos ................................................................................ 15 3. JUSTIFICACIÓN ..................................................................................................... 17 4. HIPÓTESIS ............................................................................................................. 19 5. OBJETIVOS ............................................................................................................ 20 5.1 Objetivo general ............................................................................................ 20 5.2 Objetivos específicos .................................................................................... 20 6. METODOLOGÍA ...................................................................................................... 21 6.1 Aislamiento de cepas degradadoras de hidrocarburos .................................. 21 6.1.1 Muestreo de suelo contaminado con hidrocarburos ................................... 21 6.1.2 Recuperación de microorganismos en las muestras de suelo ................... 22 6.1.3 Identificación de cultivos axénicos mediante Tinción de Gram .................. 22 6.1.4 Prueba de oxidasa ..................................................................................... 23 6.1.5 Prueba de catalasa .................................................................................... 23 6.1.6 Crecimiento en medio mineral ................................................................... 23 6.2 Amplificación de genes ................................................................................. 24 6.2.1 Análisis bioinformático ............................................................................... 24 6.2.2 Extracción de ácidos nucleicos .................................................................. 25 6.2.3 Amplificación de genes .............................................................................. 26 6.2.4 Electroforesis en gel de agarosa ................................................................ 28 6.3 Clonación de los genes aislados ................................................................... 28 6.4 Secuenciación de las construcciones y 16S .................................................. 32 7. RESULTADOS Y DISCUSIÓN ................................................................................ 33 7.1 Aislamiento de cepas degradadoras de hidrocarburos .................................. 33 7.1.1 Muestreo y recuperación de microorganismos ........................................... 33 7.1.2 Crecimiento en medio mínimo ................................................................... 34 7.1.3 Descripción de las cepas capaces de degradar catecol y n-hexano .......... 35 7.1.3.1 Agar MacConkey ................................................................................ 35 7.1.3.2 Tinción Gram ...................................................................................... 36 7.1.3.3 Prueba de oxidasa.................................................................................... 37 7.1.3.4 Agar Cetrimida ......................................................................................... 37 7.1.3.5 Prueba de catalasa................................................................................... 37 7.2 Amplificación de genes ................................................................................. 38 7.2.1 Diseño de oligonucleótidos ........................................................................ 38 7.2.2 Amplificación de secuencias ...................................................................... 44 7.3 Clonación ...................................................................................................... 47 7.3.1 Simulación in silico .................................................................................... 47 7.3.2 Clonación .................................................................................................. 48 7.4 Secuenciación ............................................................................................... 52 7.4.1 Genotipificación por 16S ribosomal ........................................................... 52 7.4.2 Secuencias de C12O y C23O .................................................................... 54 8. CONCLUSIONES ............................................................................................... 59 BIBLIOGRAFÍA ....................................................................................................... 60 | |
| dc.format | application/PDF | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Biblioteca Digital wdg.biblio | |
| dc.publisher | Universidad de Guadalajara | |
| dc.rights.uri | https://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp | |
| dc.title | Clonación de genes codificantes de catecol dioxigenasas y alcano monooxigenasas aislados de bacterias degradadoras de hidrocarburos | |
| dc.type | Tesis de Licenciatura | |
| dc.rights.holder | Universidad de Guadalajara | |
| dc.rights.holder | Ayala Gutiérrez, César Gustavo | |
| dc.coverage | GUADALAJARA, JALISCO. | |
| dc.type.conacyt | bachelorThesis | |
| dc.degree.name | LICENCIATURA EN QUIMICO FARMACEUTICOBIOLOGO | |
| dc.degree.department | CUCEI | |
| dc.degree.grantor | Universidad de Guadalajara | |
| dc.rights.access | openAccess | |
| dc.degree.creator | LICENCIADO EN QUIMICO FARMACEUTICOBIOLOGO | |
| dc.contributor.director | Velázquez Juárez, Gilberto | |
| Aparece en las colecciones: | CUCEI | |
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