Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: https://hdl.handle.net/20.500.12104/84628
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dc.contributor.advisorMuñiz Castro, Miguel Ángel
dc.contributor.advisorHernandez Vera, Gerardo
dc.contributor.advisorGuzman Davalos, Laura
dc.contributor.authorShalisko, Viacheslav
dc.date.accessioned2021-10-05T19:38:06Z-
dc.date.available2021-10-05T19:38:06Z-
dc.date.issued2019-04-23
dc.identifier.urihttps://wdg.biblio.udg.mx
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12104/84628-
dc.description.abstractRESUMEN La subfamilia Grammitidoideae (Polypodiaceae) es un grupo de helechos con una compleja historia biogeográfica. En el Neotrópico se concentran aproximadamente dos quintos de su diversidad, con Centroamérica como uno de los centros de endemismo de esta subfamilia. En el presente trabajo se trataron temas de biogeografía ecológica e histórica de Grammitidoideae en Mesoamérica, tanto en el contexto global como en el del Neotrópico. Se analizaron la nomenclatura y taxonomía de 15 géneros y 115 especies de Grammitidoideae presentes en Mesoamérica. Se llevó a cabo la estimación de las áreas de distribución de dichas especies con el método areográfico y por medio de modelos correlativos del nicho ecológico. Se realizó la estimación del patrón esperado de diversidad de Grammitidoideae en Mesoamérica aplicando los modelos sobrepuestos de distribución de las especies. Se efectuó un análisis filogenético basado en las secuencias de cpDNA en cinco loci, utilizando los métodos de verosimilitud máxima e inferencia Bayesiana. El conocimiento sobre las secuencias de cpDNA para las especies mesoamericanas de Grammitidoideae se amplió con datos de 71 muestras de 41 especies, de las cuales 18 especies se consideraron en la reconstrucción filogenética molecular por primera vez. Se hizo una estimación de las fechas de divergencia entre los linajes durante el Cenozoico aplicando la técnica de reloj molecular relajado. Se elaboró un análisis biogeográfico en forma de estimación de las áreas ancestrales para los nodos del árbol filogenético en los contextos global y neotropical. Por primera vez, fueron identificados los centros de origen y diversificación de los taxa de Grammitidoideae en el Neotrópico. Se determinaron las relaciones entre los centros de endemismo en Centroamérica y en los Andes septentrionales. Se confirmaron los nexos de parentesco y secuencia de intercambios entre la flora de Grammitidoideae en el Neotrópico y en la región África-Madagascar. Fue ampliada y redefinida la lista de los eventos de dispersión transoceánica, los cuales fueron fundamentales en la evolución del grupo. En el artículo derivado del presente trabajo (ver apéndice 2) se describió un nuevo género, Parrisia, y se propusieron nuevas combinaciones taxonómicas en los géneros Enetrosora y Zygophlebia.
dc.description.tableofcontentsCAPÍTULO 1. INTRODUCCIÓN GENERAL ........................................................................... 1 CAPÍTULO 2. LAS ESPECIES MESOAMERICANAS DE GRAMMITIDOIDEAE .................... 3 2.1 Objetivos del capítulo .................................................................................................... 3 2.2 Familia Grammitidaceae (= subfamilia Grammitidoideae) .............................................. 3 2.3 Los géneros de Grammitidoideae en Mesoamérica ....................................................... 6 2.4 Métodos de revisión y visualización de los registros de Grammitidoideae en Mesoamérica ....................................................................................................................... 7 2.5 Las especies de Grammitidoideae en Mesoamérica ................................................... 11 2.6 Referencias bibliográficas ........................................................................................... 82 CAPÍTULO 3. ANÁLISIS PREDICTIVO DE DISTRIBUCIÓN DE LAS ESPECIES ................ 89 3.1 Objetivos del capítulo .................................................................................................. 89 3.2 Supuestos en el análisis predictivo de distribución de las especies ............................. 89 3.3 Métodos de inferencia del modelo correlativo ............................................................ 104 3.4 Variables ambientales ............................................................................................... 108 3.5 Muestreo de condiciones del fondo para modelos correlativos de áreas de distribución ........................................................................................................................................ 115 3.6 Datos de presencia de especies ................................................................................ 121 3.7 Evaluación de los modelos correlativos ..................................................................... 127 3.9 Áreas de distribución potencial y su ajuste geográfico............................................... 140 3.9.1 Efecto del sesgo de esfuerzo de muestreo ......................................................... 141 3.9.2 Efecto de limitantes de dispersión ....................................................................... 144 3.9.3 Ajuste combinado por limitantes de dispersión y sesgo de muestreo .................. 147 3.10 Áreas de probable presencia de las especies ......................................................... 149 3.11 Patrón esperado de diversidad de Grammitidoideae ............................................... 152 3.12 Conclusiones y perspectivas ................................................................................... 156 3.13 Referencias bibliográficas........................................................................................ 158 CAPÍTULO 4. ANÁLISIS FILOGENÉTICO .......................................................................... 171 4.1 Objetivos del capítulo ................................................................................................ 171 4.2 Introducción ............................................................................................................... 171 4.2.1 Filogenética de helechos .................................................................................... 171 4.2.2 Estudios filogenéticos de Grammitidoideae y taxa relacionados ......................... 174 ii 4.2.3 Tiempos de origen de Grammitidoideae ............................................................. 178 4.3 Métodos .................................................................................................................... 179 4.3.1 Fuentes de datos para el análisis filogenético ..................................................... 179 4.3.2 Muestras para obtención de secuencias ............................................................. 180 4.3.3 Extracción de DNA .............................................................................................. 182 4.3.4 Amplificación, purificación y secuenciación de DNA ........................................... 183 4.3.5 Consulta de secuencias en GenBank ................................................................. 186 4.3.6 Alineación de secuencias y modelos de sustitución de nucleótidos .................... 190 4.3.7 Inferencia filogenética con métodos probabilísticos ............................................ 193 4.3.8 Estimación de tiempos de divergencia con reloj molecular ................................. 199 4.4 Resultados ................................................................................................................ 201 4.4.1 Secuencias obtenidas en laboratorio .................................................................. 201 4.4.2 Alineamientos y modelos de sustitución de nucleótidos ...................................... 203 4.4.3 Análisis filogenético ............................................................................................ 207 4.4.4 Estimación de tiempos de divergencia ................................................................ 227 4.5 Discusión ................................................................................................................... 232 4.6 Referencias bibliográficas ......................................................................................... 234 CAPÍTULO 5. ÁREAS ANCESTRALES Y EVENTOS DE DISPERSIÓN ............................ 246 5.1 Objetivos del capítulo ................................................................................................ 246 5.2 Introducción ............................................................................................................... 246 5.3 Métodos .................................................................................................................... 249 5.3.1 Análisis global de las áreas ancestrales .............................................................. 251 5.3.2 Análisis de áreas ancestrales en el Neotrópico ................................................... 253 5.4 Resultados ................................................................................................................ 255 5.4.1 Análisis global de áreas ancestrales ................................................................... 255 5.4.2 Análisis de áreas ancestrales en el Neotrópico ................................................... 271 5.6 Conclusiones ............................................................................................................. 297 5.7 Referencias bibliográficas ......................................................................................... 298 CAPÍTULO 6. CONCLUSIONES GENERALES .................................................................. 301 ANEXO 1. Mapas derivados del análisis correlativo de distribución de las especies mesoamericanas de Grammitidoideae. Predicción en México, Centroamérica y las Antillas. Anexo para el capitulo 3. .................................................................................................... 303 ANEXO 2. Artículo “Taxonomic novelties in grammitid ferns (Polypodiaceae) from Neotropics and Madagascar supported by molecular data”. Anexo para el capítulo 4. ......................... 534
dc.formatapplication/PDF
dc.language.isospa
dc.publisherBiblioteca Digital wdg.biblio
dc.publisherUniversidad de Guadalajara
dc.rights.urihttps://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp
dc.subjectHelechos Epifitos De Grammitidaceae En Mexico Y Centroamerica
dc.titleEvolución y biogeografía de los helechos epífitos de Grammitidaceae en México y Centroamérica
dc.typeTesis de Doctorado
dc.rights.holderUniversidad de Guadalajara
dc.rights.holderShalisko, Viacheslav
dc.coverageZAPOPAN JALISCO
dc.type.conacytdoctoralThesis
dc.degree.nameDOCTORADO EN CIENCIAS EN BIOSISTEMATICA, ECOLOGIA Y MANEJO DE RECURSOS NATURALES Y AGRICOLAS
dc.degree.departmentCUCBA
dc.degree.grantorUniversidad de Guadalajara
dc.degree.creatorDOCTOR EN CIENCIAS EN BIOSISTEMATICA, ECOLOGIA Y MANEJO DE RECURSOS NATURALES Y AGRICOLAS
dc.contributor.directorVazquez Garcia, José Antonio
dc.contributor.codirectorVillabos Arambula, Alma Rosa
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