Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: https://hdl.handle.net/20.500.12104/82522
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dc.contributor.advisorArciniega Castro, Marcelino
dc.contributor.advisorChàvez Chàvez, Arturo
dc.contributor.authorChàvez Rojas, Daniel
dc.date.accessioned2021-03-26T22:17:18Z-
dc.date.available2021-03-26T22:17:18Z-
dc.date.issued2018-04-27
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12104/82522-
dc.identifier.urihttps://wdg.biblio.udg.mx
dc.description.abstractLa Furina es una proteína que se expresa en la mayoría de los vertebrados, su función es activar distintos precursores de proteínas. Trabajos previos han mostrado el rol crucial que juegan los distintos iones de sodio y calcio en la activación de la proteína Furina. Sin embargo, los aspectos energéticos y estructurales que determinan tal función han sido vagamente explorados. La comprensión a detalle de dichos aspectos podría resultar crucial para el diseño de nuevos inhibidores con potencial farmacológico. Este análisis no es sencillo de establecer debido a que es necesario desacoplar los distintos elementos energéticos. Para establecer dicho análisis se propone el uso de la teoría Perturbación de Energía Libre como herramienta que permita segmentar el rol de iones en el proceso de activación. A través de este análisis se encontraron las distintas propiedades energéticas de distintas conformaciones de la Furina, lo cual permite entender que componentes son importantes para la función y estabilidad de la proteína. Furin is a protein that is expressed in the majority of vertebrates, its function is to activate different protein precursors. Earlier research has shown the crucial role that the sodium and calcium Ions play in the activation of the Furin protein. Nevertheless, the energetic and structural aspects that determine its function have been barely studied. To fully comprehend this particular phenomenon might prove crucial in finding and developing new inhibitors with pharmaceutical potential. This is not an easy task; it requires decoupling the different energetic elements. To solve this problem, we propose the use of Free Energy Perturbations; this will allow us to find the role the ions play in the activation process. Through this analysis we found the energetic properties of different conformations of Furin, which helps to understand the importance for function and stability of different components of the protein.
dc.description.tableofcontentsÍndice Índice................................................................................................................................................................67 Resumen .............................................................................................................................. 1011 Introducción....................................................................................................................... 1213 Energía libre.................................................................................................................................1213 FEP(Free Energy Perturbation)...........................................................................................1213 Dinámica Molecular..................................................................................................................1415 Proteasas ......................................................................................................................................1415 Proprotein-convertasas..........................................................................................................1516 Furina..............................................................................................................................................1516 Justificacion ........................................................................................................................ 1516 Capítulo 1............................................................................................................................ 1718 Marco teórico y antecedentes ................................................................................................1718 Repaso breve de Termodinamica y Fisica Estadistica............................................................1718 Perturbación de Energía Libre (FEP).............................................................................................1920 Dinámicas Moleculares......................................................................................................................2324 Furina..........................................................................................................................................................2728 Capitulo 2............................................................................................................................. 3031 Metodología..................................................................................................................................3031 Equipo de cómputo..................................................................................................................................3031 Dinámicas Moleculares......................................................................................................................3031 Perturbación de Energía Libre y Estimación de la Entropía...........................................3132 Simulaciones FEP en iones.............................................................................................................3233 Simulaciones FEP en iones dentro Furina ..............................................................................3233 Simulaciones FEP en iones dentro Furina en presencia de ligando..........................3334 Capítulo 3............................................................................................................................. 3637 Resultados y discusión .............................................................................................................3637 Capitulo 4............................................................................................................................. 4648 Conclusiones y recomendaciones.........................................................................................4648 Conclusiones...........................................................................................................................................4648 Recomendaciones................................................................................................................................4648 Referencias ...............................................................................
dc.formatapplication/PDF
dc.language.isospa
dc.publisherBiblioteca Digital wdg.biblio
dc.publisherUniversidad de Guadalajara
dc.rights.urihttps://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp
dc.subjectProteina Furina
dc.subjectEnergia Y Estructura
dc.titleESTUDIO DE LOS ASPECTOS ENERGÉTICOS Y ESTRUCTURALES QUE DETERMINAN EL ESTADO DE ACTIVIDAD DE LA PROTEÍNA FURINA
dc.typeTesis de Maestria
dc.rights.holderUniversidad de Guadalajara
dc.rights.holderChàvez Rojas, Daniel
dc.coverageGUADALAJARA
dc.type.conacytmasterThesis-
dc.degree.nameMAESTRIA EN CIENCIAS EN FISICA-
dc.degree.departmentCUCEI-
dc.degree.grantorUniversidad de Guadalajara-
dc.degree.creatorMAESTRO EN CIENCIAS EN FISICA-
Aparece en las colecciones:CUCEI

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