Alucinación de polimerasas a partir de sus dominios conservados

Abstract

Esta tesis aborda el problema actual de la brecha tecnológica entre la secuenciación y la síntesis de DNA, proponiendo un enfoque computacional para el diseño de nuevas DNA polimerasas con capacidad de síntesis autónoma. A partir de herramientas de inteligencia artificial como RoseTTAFold, RFDiffusion y ProteinMPNN, se diseñaron enzimas candidatas basadas en fragmentos estructurales de la Terminal desoxinucleotidil transferasa (TdT), conocida por su habilidad de sintetizar DNA sin molde. Las proteínas alucinadas fueron analizadas mediante alineamientos múltiples, modelado estructural y acoplamiento molecular con dNTPs, revelando interacciones más intensas que las observadas en la TdT original. Estos resultados sugieren un potencial para superar las limitaciones actuales de la síntesis enzimática de DNA y abren la puerta a futuros desarrollos en biología sintética y escritura genética controlada.