Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: https://hdl.handle.net/20.500.12104/98135
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dc.contributor.authorVillanueva Aguilar, Mónica Edith
dc.date.accessioned2024-03-11T18:55:15Z-
dc.date.available2024-03-11T18:55:15Z-
dc.date.issued2023-06-02
dc.identifier.urihttps://wdg.biblio.udg.mx
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12104/98135-
dc.description.abstractIntroducción: La fiebre del dengue es una enfermedad causada por el virus del dengue (DENV), el cual se clasifica en cuatro serotipos (DENV1-4). La infección por este virus puede causar un amplio espectro de síntomas clasificados en dengue no grave (DNG), dengue con signos de alarma (DCSA) y dengue grave (DG). Los genes IFITM3 y TNFA participan en la respuesta inmune innata. La proteína IFITM3 inhibe la entrada del virus a la célula y la citocina TNF-α participa en múltiples funciones del sistema inmune, incluyendo inflamación y apoptosis. Algunas variantes genéticas modifican sus funciones antivirales y podrían alterar el curso de la enfermedad. Objetivo: Evidenciar la posible asociación de las variantes de IFITM3 rs12252, TNFA rs1800629 y rs361525 con la susceptibilidad y severidad de la infección del virus del dengue. Métodos: Se analizaron muestras de sangre de 272 casos sintomáticos de dengue; de los cuales, 102 casos fueron positivos a infección por DENV (DENV+) y 170 negativos (DENV-). Muestras de 201 individuos de la población general de México se utilizaron como referencia. El ADN se aisló con el método DTAB/CTAB, la genotipificación se realizó con PCR-RFLP visualizando fragmentos en gel de poliacrilamida. Los análisis estadísticos incluyen la prueba de chi-cuadrada (χ2), la razón de momios (OR), intervalos de confianza, equilibrio Hardy-Weinberg, U de Mann-Whitney y análisis de haplotipos. La corrección de Haldane se aplicó donde fuera necesario. Resultados: La variante TNFA rs361525 se asoció con mayor riesgo de presentar enfermedad febril causado por la infección de DENV, pero también por otras causas desconocidas (Alelo A: p= 0.000, OR= 2.76, IC95%= 1.56–4.90; modelo dominante: p= 0.000, OR= 2.86, IC95% 1.56–5.26); y al comparar los casos DENV+ con DENV-, el alelo A se asoció con mayor susceptibilidad a infección por DENV (p = 0.041, OR = 1.77, IC95% = 1.02– 3.09). Ninguna variante mostró asociación con la severidad del dengue. Tres síntomas se asociaron con el alelo C de IFITM3 rs12252, cinco con el alelo A de TNFA rs1800629, y siete con el alelo A de TNFA rs361525. Conclusión: El alelo A de TNFA rs361525 está asociado con la susceptibilidad, pero no con la severidad, de presentar enfermedad febril causada por DENV. Se observó una gran variedad 2 de síntomas asociados a las variantes, la mayoría fueron síntomas característicos de DNG.
dc.description.tableofcontentsÍNDICE GENERAL I. ÍNDICE DE CUADROS ..............................................................................II II. ÍNDICE DE FIGURAS ...............................................................................III III. ABREVIATURAS ..................................................................................... IV 1 RESUMEN.................................................................................................1 2 ABSTRACT................................................................................................2 3 INTRODUCCIÓN .......................................................................................3 4 ANTECEDENTES ......................................................................................4 4.1 Epidemiología del dengue.......................................................................... 4 4.2 Clasificación y estructura del virus ............................................................. 5 4.3 Patología.................................................................................................... 7 4.4 Ciclo de replicación del DENV ................................................................... 8 4.5 Susceptibilidad ........................................................................................... 9 4.6 Proteína transmembrana inducible por interferón 3 (IFITM3)................... 11 4.7 Factor de necrosis tumoral alfa (TNF-α)................................................... 13 5 ANTECEDENTES DIRECTOS ................................................................. 15 5.1 Variantes de IFITM3 ............................................................................. 15 5.2 Variantes de TNFA ............................................................................... 16 6 JUSTIFICACIÓN...................................................................................... 17 7 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA ....................................................... 19 8 HIPÓTESIS.............................................................................................. 20 9 OBJETIVOS............................................................................................. 20 9.1 Objetivo general........................................................................................ 20 9.2 Objetivos específicos ................................................................................ 20 10 DISEÑO METODOLÓGICO ..................................................................... 21 10.1 Tipo de estudio ..................................................................................... 21 10.2 Universo de estudio .............................................................................. 21 10.3 Tamaño de muestra.............................................................................. 21 10.4 Criterios de selección............................................................................ 22 11 DIAGRAMA DE FLUJO ............................................................................ 23 12 TÉCNICAS EMPLEADAS......................................................................... 23 12.1 Aislamiento del ADN ............................................................................. 23 12.2 Amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) ............ 24 12.3 Genotipificación por polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP) .............................................................................................. 24 12.4 Electroforesis y tinción del gel de poliacrilamida................................... 25 12.5 Control de calidad de los ensayos ........................................................ 25 13 ANÁLISIS ESTADÍSTICO......................................................................... 25 14 ASPECTOS ÉTICOS ............................................................................... 26 15 RESULTADOS......................................................................................... 27 15.1 Descripción de la población de estudio................................................. 27 15.2 Distribución de frecuencias ................................................................... 29 15.3 Análisis de haplotipos ........................................................................... 33 15.4 Frecuencias de los síntomas ................................................................ 34 15.5 Asociación de las variantes con síntomas individuales......................... 36 16 DISCUSIÓN............................................................................................. 37 17 CONCLUSIÓN ......................................................................................... 42 18 APORTACIONES..................................................................................... 43 19 LIMITACIONES........................................................................................ 43 20 PERSPECTIVAS...................................................................................... 43 21 PRODUCCIÓN CIENTÍFICA .................................................................... 44 22 REFERENCIAS ....................................................................................... 45 23 ANEXOS.................................................................................................. 54 23.1 Definiciones operacionales de los casos de dengue según el InDRE .. 54 23.2 Aislamiento de ADN a partir de sangre coagulada ............................... 56 23.3 Amplificación del ADN por PCR............................................................ 59 23.4 Digestión con enzimas de restricción.................................................... 61 23.5 Electroforesis ........................................................................................ 65 23.6 Tinción del gel de poliacrilamida ........................................................... 66 23.7 Bioseguridad......................................................................................... 67 23.8 Operacionalización de Variables........................................................... 67 23.9 Cronograma de actividades .................................................................. 80 23.10 Constancias de participación en congresos.......................................... 81 23.11 Probatorio de aceptación de los artículos ............................................. 85
dc.formatapplication/PDF
dc.language.isospa
dc.publisherBiblioteca Digital wdg.biblio
dc.publisherUniversidad de Guadalajara
dc.rights.urihttps://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp
dc.subjectIfitm3 Rs12252
dc.subjectTnfa Rs1800629
dc.subjectRs361525
dc.titleAsociación de las variantes IFITM3 rs12252 y TNFA rs1800629 y rs361525 con la susceptibilidad y severidad de la infección por dengue
dc.title.alternativeAsociación de las variantes IFITM3 rs12252 y TNFA rs1800629 y rs361525 con la susceptibilidad y severidad de la infección por dengue
dc.typeTesis de Doctorado
dc.rights.holderUniversidad de Guadalajara
dc.rights.holderVillanueva Aguilar, Mónica Edith
dc.coverageGUADALAJARA, JALISCO
dc.type.conacytdoctoralThesis
dc.degree.nameDOCTORADO EN GENETICA HUMANA
dc.degree.departmentCUCS
dc.degree.grantorUniversidad de Guadalajara
dc.degree.creatorDOCTOR EN GENETICA HUMANA
dc.contributor.directorMontoya Fuentes, Héctor
dc.contributor.codirectorRizo De La Torre, Lourdes Del Carmen
dc.contributor.codirectorGallegos Arreola, Martha Patricia
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