Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: https://hdl.handle.net/20.500.12104/98134
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dc.contributor.authorSantana Hernández, Jennifer
dc.date.accessioned2024-03-11T18:55:14Z-
dc.date.available2024-03-11T18:55:14Z-
dc.date.issued2023-08-14
dc.identifier.urihttps://wdg.biblio.udg.mx
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12104/98134-
dc.description.abstractRESUMEN La leucemia linfoblástica aguda de tipo B (LLA-B) es el tipo de cáncer pediátrico más común, con un 80% de todos los casos. Para su estudio se considera perfil inmunológico, características citomorfológicas, citogenético-moleculares y clínico-hematológicas. Además, monitorea la respuesta inicial al tratamiento para estratificación de riesgo y seguimiento por enfermedad por mínima residual (EMR). Los cambios genéticos detectados recurrentes y con significado clínico demostrado son usados como biomarcadores que implican perturbación de vías celulares como la regulación del ciclo celular, regulación transcripcional, modificación de la cromatina y afectación de factores de transcripción (FT) involucrados en el desarrollo y diferenciación linfoide. Con base en esto, estudios han determinado que las alteraciones de pérdida de función en el gen IKZF1 (FT involucrado en etapas tempranas del linaje linfoide y de diferenciación de los precursores B) son un marcaje distintivo en LLA-B. No obstante, se ha mencionado que las deleciones del gen IKZF1 tienen una frecuencia del 15% y el riesgo aumenta cuando existe la presencia de la fusión génica BCR-ABL1, asociándolo a un mal pronóstico. Será relevante asociar estos elementos con otras alteraciones genéticas y marcadores clínico- bioquímicos durante la evolución de la enfermedad, al diagnóstico hasta una cura o muerte y hacer un análisis multivariado que permita definir a las deleciones del gen IKZF1 y sus isoformas como biomarcadores pronóstico y de riesgo. El objetivo es determinar si existe asociación entre las deleciones del gen IKZF1 con alteraciones genéticas en el pronóstico, respuesta tratamiento y recaída en la evolución de LLA-B infantil. Incluimos 83 casos pediátricos con diagnóstico de LLA-B, en el Hospital Civil “Dr. Juan I Menchaca”, para la detección de las principales alteraciones cromosómicas al diagnóstico y recaída. Se aplicó amplificación de sondas dependiente de ligandos múltiples (MLPA) para identificar las deleciones del gen IKZF1 y otros genes de la diferenciación linfoide y RT- PCR para determinar la cuantificación relativa de la expresión de IKZF1. Se detectó con más frecuencia deleción de los genes IKZF1, EBF1, PAX5, CDKN2A/B y ETV6, asimismo ganancia de CRLF2. No podemos mencionar en nuestro grupo de estudio sea la fusión génica BCR/ABL1 más la presencia de las deleciones de IKZF1 un potencial biomarcador de riesgo, porque la n encontrada fue menor. Se ha observado que IKZF1 se encuentra en la mayoría de los casos pediátricos disminuida su expresión.
dc.description.tableofcontentsÍNDICE GENERAL RESUMEN______________________________________________________________________ - 10 - ABSTRACT ___________________________________________________________________________________________________ - 11 - INTRODUCCIÓN _____________________________________________________________________________________________ - 12 - MARCO TEÓRICO____________________________________________________________________________________________ - 13 - JUSTIFICACIÓN ______________________________________________________________________________________________ - 33 - PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA________________________________________________________________________ - 34 - PREGUNTA DE INVESTIGACIÓN____________________________________________________________________________ - 34 - HIPÓTESIS ___________________________________________________________________________________________________ - 35 - OBJETIVO GENERAL_________________________________________________________________________________________ - 35 - OBJETIVOS PARTICULARES ________________________________________________________________________________ - 35 - DISEÑO METODOLÓGICO___________________________________________________________________________________ - 36 - TIPO DE ESTUDIO ____________________________________________________________________________________________- 36 - GRUPO DE ESTUDIO__________________________________________________________________________________________- 36 - UNIVERSO DE ESTUDIO______________________________________________________________________________________- 36 - PERIODO DE ESTUDIO _______________________________________________________________________________________- 36 - TAMAÑO DE MUESTRA ______________________________________________________________________________________- 36 - CRITERIOS DE INCLUSIÓN___________________________________________________________________________________- 37 - CRITERIOS DE NO INCLUSIÓN_______________________________________________________________________________- 37 - CRITERIOS DE ELIMINACIÓN________________________________________________________________________________- 37 - OPERACIONALIZACIÓN DE VARIABLES_____________________________________________________________________- 37 - DIAGRAMA DE FLUJO ________________________________________________________________________________________- 38 - PROCEDIMIENTO METODOLÓGICO________________________________________________________________________ - 40 - PASO 1. EXTRACCIÓN DE DNA ___________________________________________________________________________________- 40 - PASO 2. MLPA__________________________________________________________________________________________________- 40 - PASO 1. EXTRACCIÓN DE RNA ___________________________________________________________________________________- 42 - PASO 2. PCR EN TIEMPO REAL (RT- QPCR) ______________________________________________________________________- 43 - ANÁLISIS ESTADÍSTICO_____________________________________________________________________________________ - 44 - CONTROL DE CALIDAD, COMPROBACIÓN Y VALIDEZ ____________________________________________________ - 44 - - 5 - CONSIDERACIONES ÉTICAS ________________________________________________________________________________ - 44 - CONSIDERACIONES DE BIOSEGURIDAD___________________________________________________________________ - 45 - RESULTADOS ________________________________________________________________________________________________ - 46 - CONCLUSIONES________________________________________________________________________________________________128 LIMITACIONES DEL ESTUDIO ________________________________________________________________________________128 APORTACIONES _______________________________________________________________________________________________128 PERSPECTIVAS ________________________________________________________________________________________________128 REFERENCIAS _________________________________________________________________________________________________129 ANEXOS ________________________________________________________________________________________________________135 ANEXO 1. CARTAS DE CONSENTIMIENTO INFORMADO ____________________________________________________135 ANEXO 2. DETERMINACIÓN CITOMORFOLÓGICA___________________________________________________________138 ANEXO 3. INMUNOFENOTIPO POR CITOMETRÍA DE FLUJO ________________________________________________138 ANEXO 4. CARIOTIPO__________________________________________________________________________________________139 ANEXO 5. HIBRIDACIÓN “IN SITU” FLUORESCENTE_________________________________________________________141 ANEXO 6.OBTENCIÓN DEL BOTÓN CELULAR _______________________________________________________________142 ANEXO 7. EXTRACCIÓN DE DNA______________________________________________________________________________143 ANEXO 8. AMPLIFICACIÓN DE SONDAS POR LIGANDOS MÚLTIPLES (MLPA) _____________________________144 ANEXO 9. EXTRACCIÓN DE RNA POR TRIZOL________________________________________________________________147 ANEXO 12. RT-QPCR ___________________________________________________________________________________________155 ANEXO 13. PREDICCIÓN DE LA DELECIÓN DEL GEN IKZF1 EN ASOCIACIÓN CON VARIABLES PRONÓSTICO, RESPUESTA TRATAMIENTO, RECAÍDA, GANANCIAS GÉNICAS Y OTRAS ALTERACIONES NUMÉRICA/ESTRUCTURAL EN LLA INFANTIL______________________________________________________________157 CRONOGRAMA ___________________________________________________________________ 173
dc.formatapplication/PDF
dc.language.isospa
dc.publisherBiblioteca Digital wdg.biblio
dc.publisherUniversidad de Guadalajara
dc.rights.urihttps://www.riudg.udg.mx/info/politicas.jsp
dc.subjectGen Ikzf1
dc.subjectLla-B Infantil
dc.titleDELECIÓN DEL GEN IKZF1 EN ASOCIACIÓN CON OTRAS ALTERACIONES GENÉTICAS EN LA EVOLUCIÓN DE LLA-B INFANTIL
dc.title.alternativeDELECIÓN DEL GEN IKZF1 EN ASOCIACIÓN CON OTRAS ALTERACIONES GENÉTICAS EN LA EVOLUCIÓN DE LLA-B INFANTIL
dc.typeTesis de Doctorado
dc.rights.holderUniversidad de Guadalajara
dc.rights.holderSantana Hernández, Jennifer
dc.coverageGUADALAJARA, JALISCO
dc.type.conacytdoctoralThesis
dc.degree.nameDOCTORADO EN GENETICA HUMANA
dc.degree.departmentCUCS
dc.degree.grantorUniversidad de Guadalajara
dc.degree.creatorDOCTOR EN GENETICA HUMANA
dc.contributor.directorCorona Rivera, Alfredo
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